Neben der künstlerischen Ausbildung stellen wissenschaftliche Lehre und Forschung die zweite Säule der HMT Leipzig dar. Neben der Möglichkeit der Promotion und des Graduiertenstudiums sowie der Habilitation tragen regelmäßig Tagungen, Symposien und Kolloquien zu diesem Bereich bei. Hinzu kommen die transdisziplinäre Schriftenreihe der HMT und diverse drittmittelgeförderte Forschungsprojekte, die quer durch die Fachrichtungen der Hochschule angesiedelt sind.